荷兰癌症研究所编制出存在于癌症转移灶中细菌的详细目录
荷兰癌症研究所的研究人员编制了一份生活在癌症转移灶中的细菌详细目录。在对4000多个肿瘤进行分析后,他们揭示了这些共栖生物的多样性,以及它们如何与癌细胞及其周围环境相互作用。
例如,某些细菌与免疫疗法的不良反应有关。这项研究为更好地了解细菌如何帮助或阻碍癌症(治疗),以及我们如何利用这一点为患者谋福利指明了方向。研究人员今天在科学杂志《细胞》上发表了他们的研究成果。
在我们的身体上和体内生活着数十亿种微生物:细菌、病毒和酵母菌--我们的微生物群。我们需要它们,它们也需要我们。例如,细菌帮助我们消化食物,与我们的免疫系统合作对抗病原体。肠道细菌尤其受到广泛研究,包括癌症方面的研究。例如,它们可以影响免疫疗法和化疗的效果。
但是,这些微小的同居者也会在肠道外栖息。例如,肿瘤中就有细菌。借助新技术,研究人员正在更好地找出它们是哪些微生物。但是,细菌如何进入肿瘤以及它们在肿瘤中究竟做了什么,这些问题在很大程度上仍是未知数,因此还不清楚它们对疾病和治疗效果有多重要。
26 种癌症类型
由于许多病人最终死于转移瘤,而且许多治疗方法都针对转移瘤,因此埃米尔-沃伊斯特和洛德维克-韦塞尔斯的研究小组对这些转移瘤进行了更深入的研究。毕竟,人们对这些肿瘤中的细菌知之甚少。他们与荷兰癌症研究所(Netherlands Cancer Institute)和Oncode研究所(Oncode Institute)等机构的同事一起绘制了癌症转移灶中细菌的分布图。
研究人员从 26 种癌症的 4000 多个转移灶组织中分析了DNA的密码。从这些遗传物质中,您不仅可以看到哪些人体细胞,还可以看到哪些细菌--因为这些细菌也有 DNA。为此,他们使用了哈特维格医学基金会生成的临床信息和 DNA 数据。
数据分析和结果
有了这些庞大得难以想象的信息(400 TB),他们利用计算机的能力找出了哪些细菌聚集在哪些地方(见图)。这需要大量巧妙的编程,因为在这样一块组织中,细菌的 DNA 相对较少。
研究人员托马斯-巴塔利亚(Thomas Battaglia)说:"令人惊讶的是,不仅仅是结肠癌转移灶含有大量细菌。人们可能会想到,因为我们的大多数细菌都居住在结肠中,它们有可能在转移过程中从结肠转移到身体的其他部位。另外,转移灶中存在哪些细菌与身体的位置、那里的条件和癌症类型密切相关。"
细菌和治疗效果
他们还发现了细菌与疗效之间的联系。例如,转移灶中含有镰刀菌属的肺癌患者对免疫疗法的反应比没有这种细菌的患者差。托马斯:"我们还注意到,细菌群落越多样化,邻近的肿瘤细胞就越活跃"。
"我们的工作为探索新的治疗方式打开了大门,例如针对可能有助于肿瘤的细菌的治疗,"合著者 Iris Mimpen 说。"它帮助我们了解肿瘤的复杂环境是如何运作的,在这个环境中,各种细胞--包括细菌--生活在一起并相互影响"。
编译自:ScitechDaily