TSUBAME 2.0计划搭建1408个Thin节点，CPU 2816颗核心数量共计17664个，GPU 4224颗，通用计算单元数量高达189万个。总运算能力2391.35TFLOPS，其中 CPU运算能力215.99TFLOPS，GPU运算能力2175.36TFLOPS。
整套系统共将使用约100TB内存，内存带宽720TB/sec，200TB固态硬盘存储，7.13PB 硬盘存储，另有8PB存储子系统。节点和存储系统间使用Infiniband光网络连接，子系统和外部连接使用10Gb以太网，支持Windows HPC和SUSE Linux操作系统。
TSUBAME 2.0的设计和管理由NEC公司完成，惠普则负责开发制造各运算节点。整套系统预计占地200平方米，通过液冷散热系统和高效率电源的应用，能效比将是第 一代系统的30倍。
东京工业大学表示，将从8月中旬开始逐步关停TSUBAME 1，8月份开始拆卸节点，9月份启动新机安装，10月份开始进行试验，年内实现TSUBAME 2.0稳定运行。预计搭建TSUBAME 2.0和未来四年运行费用合计在32亿日元以下。
