纵向研究显示，导致鼠疫的细菌耶尔森氏菌被一次又一次地重新引入人群中。研究鼠疫起源和演变的科学家们检查了来自丹麦的数百颗古人类牙齿，试图解决关于鼠疫在斯堪的纳维亚半岛的到来、持续存在和传播的长期问题。

在第一个此类纵向研究中，研究人员专注于一个地区的800年（公元1000-1800年之间），他们重建了耶尔森氏菌基因组，这是导致鼠疫的细菌，并表明它一次又一次地从欧洲其他地区被重新引入丹麦人口中，也许是通过人类的流动，产生了毁灭性的影响。

这些历史样本取自位于全国各地13个不同考古遗址的近300人。

该研究的主要作者之一、麦克马斯特大学古代DNA中心的研究生Ravneet Sidhu说："我们知道欧洲各地的鼠疫爆发持续了大约500年，但关于它在丹麦的传播，历史档案中记载的很少。"

来自里贝大教堂Lindegården发掘现场的遗物，年代在9至19世纪之间。资料来源：日德兰半岛西南部博物馆

麦克马斯特的研究人员与丹麦和马尼托巴的历史学家和生物考古学家团队合作，对这一时期丹麦出现的不同鼠疫菌株之间的关联性和差异进行了深入研究。

他们利用从古代牙齿中提取的片段重建了鼠疫杆菌的基因组并对其进行了测序，这些片段可以将血液感染的痕迹保存几个世纪。他们将鼠疫基因组相互比较，并与它们的现代亲属进行比较。

研究人员在13个在三个世纪内生活和死亡的人身上发现了阳性鼠疫样本。

这些样本中的9个提供了足够的遗传信息，以得出关于鼠疫在丹麦持续存在的进化结论。这些结果创造了一幅城市和农村人口被无情的瘟疫浪潮冲击的画面。

共同第一作者Ravneet Sidhu在麦克马斯特的古代DNA中心检查一颗古代牙齿。图像来源: Matt Clarke, McMaster University

"鼠疫耶尔森氏菌重新引入丹麦社区的频率很高，这与这一时期大多数死亡是由新引入的病原体造成的假设相一致。"南丹麦大学ADBOU的骨骼收藏馆馆长和古地理学家Jesper L. Boldsen说："病原体引入和死亡率之间的这种联系阐明了人口演变的基本方面，不仅是在丹麦，而且在整个欧洲大陆。

今天在《当代生物学》杂志上报告的分析显示，丹麦的鼠疫耶尔森氏菌序列与来自其他欧洲国家（包括波罗的海地区和俄罗斯）的中世纪和现代早期菌株穿插在一起，而不是来自几个世纪以来从自然库中重新出现的单一国内菌群。

"丹麦的鼠疫证据，无论是历史还是考古，都比其他一些地区，如英格兰和意大利要稀少得多。这项研究首次确定了中世纪丹麦的鼠疫，因此使我们能够将丹麦的经验与其他地方的疾病模式联系起来，"该研究的共同作者、马尼托巴大学人类学助理教授Julia Gamble说。

在惊人的细节中，研究人员描述了已知最早出现在丹麦Ribe镇的鼠疫耶尔森氏菌，可以追溯到1333年的黑死病，它在Tirup等农村地区的出现--那里没有现存的历史证据--以及它在1649年的消失。

鼠疫在丹麦袭击的大多数地方都是港口城市，但最后一次爆发的鼠疫袭击了该国中心的一个没有水的小农村，这表明鼠疫是通过陆地输入的。

鼠疫是一种啮齿类动物的疾病，但显然结果表明人类促进了鼠疫的传播，要么是通过与人类一起旅行的啮齿类动物，要么是通过他们身上的其他媒介，如虱子。

"这些结果揭示了过去和现在的鼠疫经历之间的新联系，并增加了我们对重新出现的疾病的分布、模式和毒力的理解，"该论文的高级作者、麦克马斯特古DNA中心主任和迈克尔-G-德格罗特传染病研究所的一名调查员亨德里克-波因纳说。"我们可以利用这项研究和我们采用的方法来研究未来的大流行病。"