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利用推断祖先的方法 科学家揭开了个性化癌症治疗的秘密
发布日期:2023-04-10 01:37:52  稿源:cnBeta.COM

研究人员已经开发出了从肿瘤DNA和RNA中准确推断大陆祖先的软件,这可能有助于早期癌症检测和个性化治疗。由于准确率超过95%,该团队现在正在研究更多的区域特异性,并针对个人基因组序列完善其软件。

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知道你的祖先来自哪里可能是改善癌症治疗的关键吗?也许吧,但这把钥匙会在哪里?我们如何能从癌症的祖先根源追溯到现代的解决方案?对于冷泉港实验室(CSHL)的研究教授Alexander Krasnitz来说,答案可能深藏在庞大的数据库和医院档案中,其中包含数十万的肿瘤样本。

Krasnitz和CSHL博士后研究员Pascal Belleau正在努力揭示癌症和种族或民族之间的谱系关系。他们已经开发了新的软件,可以从肿瘤的DNA和RNA准确地推断出大陆的祖先。他们的工作也可能帮助临床医生开发早期癌症检测和个性化治疗的新策略。

"为什么不同种族和民族的人患不同类型的癌症的比例不同?"克拉斯尼茨说。"他们有不同的习惯、生活条件、接触--所有种类的社会和环境因素。但也可能有遗传因素。"

克拉斯尼茨的团队使用混合DNA档案训练他们的软件工具。他们从已知背景的癌症和不相关的无癌基因组中创建了这些档案。然后他们用已知血统的病人的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌标本测试了该软件的性能。该团队发现该软件将他们的杂交图谱与大陆人口相匹配,准确率超过95%。

Krasnitz说:"我们有一个很好的模型来建立,但是很少有个人来自单一的祖先。我们在某种程度上都是混合的。因此,现在我们正在努力深入研究,测试未知祖先的肿瘤样本,揭示祖先的混合体,并实现更多的区域特异性"。多么具体?就目前而言,认为西非与东非是相对的。"

Krasnitz和Belleau最近加入了一项与Northwell Health和SUNY Downstate医疗中心合作的结肠直肠癌研究。这项研究使他们能够探索结肠直肠癌如何根据特定的种族或民族以不同的方式进行基因突变。他们希望进一步完善他们的软件,不仅推断整个基因组的祖先,而且推断其中的每一个个体序列。

"Belleau说:"如果我们能够识别出更多容易受到不同癌症或其他侵略性疾病影响的局部祖先,它可以帮助我们确定基因组的特定部分,并针对它进行治疗。"

现在,一个简单的DNA拭子可以告诉你你来自哪里以及你会遗传哪些疾病。在未来,它可能也会给你战胜它们的手段。

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