一个国际海洋生物学家小组发现了古代RNA病毒的残余，这些病毒嵌入生活在造礁珊瑚内的共生生物的DNA中。这些RNA片段来自1.6亿年前感染共生体的病毒。这一发现在6月1日发表在《自然》杂志《通信生物学》上的一项开放性研究中得到了描述，它可以帮助科学家了解今天的珊瑚和它们的伙伴是如何抵御病毒感染的。

但这是一个令人惊讶的发现，因为大多数RNA病毒并不以将自己嵌入它们所感染的生物体的DNA中而闻名。

研究表明，内源性病毒元素，或EVEs，广泛出现在珊瑚共生体的基因组中。这些单细胞藻类被称为甲藻，生活在珊瑚体内，并为它们提供戏剧性的色彩。EVE的发现强调了最近的观察，即除逆转录病毒以外的病毒可以将其遗传密码的片段整合到其宿主的基因组中。

海洋生物学家对Pocillopora珊瑚的珊瑚礁进行采样。莱斯大学和俄勒冈州立大学的研究人员对珊瑚进行了研究，并在其共生体的基因组中发现了非逆转录病毒的片段，这可能是数百万年前感染的结果。

"那么它为什么会出现在那里呢？"研究的共同作者、莱斯大学的Adrienne Correa问道。"这可能只是一个意外，但是人们开始发现这些'意外'比科学家以前认为的要频繁，而且它们在各种宿主中都被发现，从蝙蝠到蚂蚁到植物到藻类。"

一种RNA病毒出现在珊瑚共生体中也是一个惊喜。

"这就是使这个项目对我来说如此有趣的原因，"研究的主要作者Alex Veglia说，他是Correa研究小组的一名研究生。"根据我们所知道的，这种病毒真的没有理由出现在共生体的基因组中。"

这项研究得到了塔拉海洋基金会和国家科学基金会的支持，由俄勒冈州立大学的两位科学家，博士后学者Kalia Bistolas和海洋生态学家Rebecca Vega Thurber领导。这项研究提供了线索，可以帮助科学家更好地了解病毒对珊瑚礁健康的生态和经济影响。

莱斯大学研究生Alex Veglia和海洋生物学家Adrienne Correa共同领导了一项研究，在珊瑚共生体的基因组中发现了非逆转录病毒的片段。资料来源：莱斯大学

研究人员没有在过滤后的海水样本中或在无甲藻的石珊瑚、水珊瑚或水母的基因组中发现来自RNA病毒的EVEs。但是EVEs在从几十个珊瑚礁地点收集的珊瑚共生体中普遍存在，这意味着致病病毒曾经--而且可能仍然--对其目标宿主很挑剔。

"地球上的病毒有很大的多样性，"Correa说，包括逆转录病毒在内的病毒有很多方式通过感染宿主进行复制。"我们的研究很酷的一个原因是这种RNA病毒不是一种逆转录病毒，鉴于此，你不会期望它能整合到宿主的DNA中。"

莱斯大学研究生Alex Veglia为莱斯大学和俄勒冈州立大学的研究人员的一项研究对珊瑚进行采样，该研究在珊瑚共生体的基因组中发现了非逆转录病毒的片段。背景是莱斯大学海洋生物学家Adrienne Correa。

Correa说："在相当长的几年里，我们在珊瑚群中看到了大量的病毒，但很难确定它们感染的是什么，因此，这可能是我们拥有的关于珊瑚群相关病毒的实际宿主的最好、最具体的信息。现在我们可以开始问，为什么共生体保留了那个DNA，或部分基因组。为什么它在很久以前没有丢失？"

EVEs已经保存了数百万年，这一发现表明它们可能以某种方式对珊瑚共生体有益，并且有某种机制驱动EVEs的基因组整合。

Veglia说："接下来我们可以有很多途径，比如这些元素是否被用于甲藻内的抗病毒机制，以及它们如何可能影响珊瑚礁的健康，特别是当海洋变暖时，"。

"如果我们面对的是海水温度的上升，那么共生藻类物种是否更有可能包含这种内源性的病毒元素？在它们的基因组中拥有EVE，是否会提高它们抵御当代RNA病毒感染的几率？在另一篇论文中，我们表明，当珊瑚经历热应力时，RNA病毒的感染增加。所以有很多移动的部分。而这是这一难题的另一个很好的部分。"

Correa说："我们不能假设这种病毒有负面作用。但与此同时，它看起来确实在这些温度压力条件下变得更有生产力"。