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科学家解码新型高效抗生素Clovibactin
发布日期:2023-10-29 16:00:26  稿源:cnBeta.COM

研究人员从一种土壤细菌中发现了一种新型抗生素 Clovibactin。它展示了一种独特的对抗细菌细胞壁的机制,为对抗具有抗药性的"超级细菌"带来了希望,并降低了细菌抗药性的脆弱性。不过,它的商业化应用还需要进一步的研究。

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细菌病原体耐药性的增加令人担忧。普通药物对传染病失效的风险越来越大。因此,全球科学家都在寻找新的强效化合物。

波恩大学、德国感染研究中心(DZIF)、乌得勒支大学(荷兰)、波士顿东北大学(美国)和剑桥 NovoBiotic 制药公司(美国)的研究人员现已发现并破译了一种新型抗生素的作用模式。Clovibactin 提取自一种土壤细菌。这种抗生素在攻击细菌细胞壁方面非常有效,其中包括许多具有多重抗药性的"超级细菌"。相关研究成果最近发表在著名的《细胞》杂志上。

波恩大学药物微生物学研究所和波恩大学医院的 Tanja Schneider 教授博士说:"我们迫切需要新的抗生素,以便在对抗耐药性细菌的竞争中保持领先。"她补充说,近几十年来,市场上出现的抗细菌病原体的新物质并不多。

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(左起)Annika Krüger、Tanja Schneider 教授、Stefania De Benedetti 博士和 Fabian Grein 博士。图片来源:Gregor Hübl/Uni Bonn

"与目前使用的抗生素相比,Clovibactin是一种新型抗生素。"跨地区合作研究中心"抗生素细胞MAP"的共同发起人,同时也是跨学科研究领域"生命与健康"和卓越研究集群"免疫感觉2"的成员说。药物微生物学研究所与德国感染研究中心合作,专门研究候选抗生素的作用模式。

土壤细菌 Eleftheria terrae subspecies carolina 的名字中介绍了它的原产地:它是从美国北卡罗来纳州的土壤样本中分离出来的,并产生新的抗生素化合物 clovibactin,以保护自己免受竞争细菌的侵害。Tanja Schneider解释说:"这种新型抗生素通过阻断重要的构建基块,同时攻击细菌细胞壁的多个部位。它能以非同寻常的强度与这些构建模块特异性结合,并通过破坏细菌的细胞膜杀死它们。"

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来自不同学科和国家的研究小组通力合作,终于揭开了它的神秘面纱。由美国波士顿东北大学抗菌药发现中心的 Kim Lewis 教授和美国剑桥 NovoBiotic 制药公司领导的研究小组利用 iCHip 设备发现了Clovibactin。这样就可以在实验室中培养细菌,而这些细菌以前被认为是不可培养的,更无法用于开发新的抗生素。

NovoBiotic Pharmaceuticals, LLC 公司总裁 Dallas Hughes 博士说:"我们发现了这种令人兴奋的新抗生素,进一步验证了 iCHip 培养技术可以从以前无法培养的微生物中发现新的治疗化合物。该公司已证明Clovibactin具有很好的抗广谱细菌病原体的活性,并在临床前研究中成功治疗了小鼠。"

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药物微生物研究所的 Tanja Schneider 教授和她的团队。图片来源:Gregor Hübl/Uni Bonn

塔尼娅-施奈德领导的研究人员阐明了这种新型抗生素的作用模式。波恩大学的研究人员证明,Clovibactin能选择性地、高度特异性地与细菌细胞壁成分的焦磷酸基团结合。荷兰乌得勒支大学化学系的 Markus Weingarth 教授研究小组揭示了这种相互作用的确切形式。研究人员利用固态核磁共振光谱,在与细菌细胞内相似的条件下,破译了Clovibactin与细菌目标结构脂质 II 复合物的结构。这些研究表明,Clovibactin能抓住焦磷酸基团。这也是"Clovibactin"名称的由来,"Clovibactin"源于希腊语"Klouvi"(笼子),因为它像笼子一样包围着目标结构。

Clovibactin 主要作用于革兰氏阳性细菌。这些细菌包括"医院病原体",如 MRSA 细菌,也包括影响全球数百万人的广泛传播的结核病病原体。Tanja Schneider 说:"我们非常确信,细菌不会这么快就对Clovibactin产生抗药性。这是因为病原体无法轻易改变细胞壁结构单元来破坏抗生素--因此它们的致命弱点依然存在。"

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但Clovibactin可以做得更多。在与目标结构对接后,它会形成超分子丝状结构,紧紧包裹并进一步破坏细菌的目标结构。遇到Clovibactin的细菌还会受到刺激,释放出某些酶,即所谓的自溶酶,然后不受控制地溶解自己的细胞膜。Tanja Schneider 说:"这些不同机制的结合是抗药性异常顽强的原因。这表明,作为新抗生素候选者的细菌的自然多样性中仍然存在潜力。"

马库斯-魏因加思教授说:"如果没有合作伙伴之间的跨学科合作,就不可能成功迈出对抗抗药性的重要一步。研究小组现在计划利用其研究成果进一步提高Clovibactin的有效性。但距离新抗生素上市还有很长的路要走。"

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