据外媒报道，最近不少iPhone 6s用户在苹果在线支持社区投诉，从iCloud中恢复备份数据后，他们的信息和通话记录数据丢失。另外有部分用户也丢失了一些额外的数据，包括健康数据及Safari浏览历史记录等。目前尚不清楚导致该问题出现的真正原因，但是不少人猜测这是否是由于iOS 9.0.1系统的不稳定造成的，抑或是iCloud恢复备份数据过程中出现了未知错误，才导致了这个BUG的发生。

部分用户提出的解决方案是确保新旧两台手机都能升级到iOS 9.1，在原先设备上运行新的备份，然后重新设置新机的出厂设置。这点从理论上能安全保证新机从iCloud恢复备份数据。 或者更保险的方式是使用iTunes进行备份和备份恢复。

苹果公司相关人员表示已收到该问题的反馈，并在努力寻找解决方案，不过尚未就此事发布公告。