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基因测序发现洪水病原体的意外来源
发布日期:2023-12-28 10:27:18  稿源:cnBeta.COM

一张包含可见光和红外线数据的 NASA 图像显示,飓风"佛罗伦萨"过后,北卡罗来纳州沿海水道中存在溶解有机物,包括潜在的抗生素病原体。研究推翻了之前关于北卡罗来纳州沙门氏菌污染源的看法,将矛头指向河流和溪流而非养猪场,并呼吁修订疾病控制策略。

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研究人员在《地理健康》(Geohealth)杂志上报告说,当地的河流和溪流是 2018 年佛罗伦萨飓风过后北卡罗来纳州沿海地区肠炎沙门氏菌污染的源头,而不是之前怀疑的该地区大量养猪场。

对疾病控制的影响

这些发现对于控制洪水事件后由抗生素耐药病原体引起的疾病传播具有重要意义,尤其是在发展中国家的沿海地区,这些地区受到热带风暴增多的严重影响。

这项研究由伊利诺伊大学厄巴纳-卡马佩恩分校土木与环境工程系教授阮海伦和研究生毛雨晴领导,利用基因追踪技术从北卡罗来纳州沿海地区的环境样本中追踪肠杆菌的存在和来源。

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研究生毛雨晴(左)和教授阮海伦(Helen Nguyen)。资料来源:UIUC

"耐抗生素病原体引起的感染仅在美国每年就造成约280万人患病,3.6万人死亡,"Nguyen说。"这些感染很容易在全球范围内传播,是急剧增长的医疗保健系统的主要负担,但通过缓解这些感染是可以预防的"。

研究结果和方法

研究报告指出,由于洪水中经常发现人类和动物粪便的遗传标记,人们通常认为废水源、化粪池系统和畜牧场是向环境中传播抗生素耐药细菌和遗传物质的罪魁祸首。然而,目前还没有任何已知的研究能最终确定污染物的来源点。

Nguyen 说:"北卡罗来纳州沿海是一个很好的案例研究区域,因为这里有大量的养猪场和私人化粪池系统,而且热带风暴造成的沿海洪水也相当常见。"

佛罗伦萨飓风过后三周,Nguyen 的团队从北卡罗来纳州农业生产区猪场下游的水体中采集了 25 份水样,其中 23 份含有肠道病毒细菌。

研究人员利用高保真全基因组测序分析了自由浮动遗传标记--染色体和质粒,发现佛罗伦萨飓风后采集的样本中的肠炎双球菌并非来自动物或粪便。小组从基因上追溯了这些细菌的来源,它们来自当地的许多小河流和小溪流,这意味着这些病原体已经在自然环境中建立了自己的根基。

研究的广泛背景和未来研究

Nguyen说:"随着气候变化带来气温升高--细菌在气温升高的环境中茁壮成长--以及可能出现更大、更频繁的热带风暴,研究人员和政策制定者需要认识到我们研究结果的重要性。在设计减灾计划以防止飓风过后病原菌传播时,农业和人类废水不应该是唯一考虑的来源。"

阮的团队计划将这项研究扩展到沿海地区以外,并正在与其他校园研究人员合作,研究加拿大鹅粪便中的病原体在伊利诺伊州的传播情况。

参考文献:《飓风佛罗伦萨洪水过后肠炎沙门氏菌的本地和环境蓄水池》,作者:Yuqing Mao、Mohamed Zeineldin、Moiz Usmani、Antarpreet Jutla、Joanna L. Shisler、Rachel J. Whitaker 和 Thanh H. Nguyen,2023 年 11 月 3 日,GeoHealth。

doi: 10.1029/2023gh000877

编译来源:ScitechDaily

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