日本理化学研究所发生与再生科学综合研究中心副主任笹井芳树5日自杀。由于笹井是撰写STAP细胞论文的理研学术带头人小保方晴子的导师，被指存在诸多疑点的一系列STAP细胞问题预计将难以解开全部谜团。理研正在对论文进行重新调查，但少了笹井这个关键人物后调查必将面临困局，小保方正在进行的STAP细胞验证实验也可能会受到影响。

理研原计划近期启动正式调查，但广报室长加贺屋悟5日在文部科学省举行的记者会上表示，由于笹井与STAP论文写作关系颇深，他的去世将会影响到新的调查工作。

笹井指导2篇STAP论文，且在补充论文的撰写中与小保方以及山梨大学教授若山照彦一同担任责任人。分析认为，英国科学杂志《自然》是因笹井等合著者的名望而决定刊登论文的。

理研已承认小保方主论文存在违规，但对补充论文的调查则态度消极。有意见认为，这是因为笹井担任了责任人。

该研究中心主任竹市雅俊5日透露，笹井曾在3月提出“想辞去副主任之职”。

理研还在进行相关实验，由合著者丹羽仁史等学术带头人验证STAP是否存在，但看似进展得并不顺利。小保方正在另行展开实验，她表示笹井的自杀“十分震惊”（加贺屋语），此事将造成巨大影响。